Binanın uzun yıllar boyunca çatıdan su alması dolayısıyla hem çatıda, hem taşıyıcı sistemde hem de sıvalarda ve süslemelerde hasarlar mevcuttu. Öncelikle çatıda çürüyen elemanlar değiştirildi ve bazı kirişlerde de güçlendirme yapıldı. Çatı, soğuk uygulama yalıtım malzesiyle kaplandı. Yapının karkasında da sağlamlaştırmalar yapıldı. Kabaran ve yerlerinden düşmek üzere olan müzeyyen duvar ve tavan sıvalarının tamiri restorasyonun en hassas kısmını oluşturdu. Sıvaların bir kısmı, açılan ufak deliklerden arkalarına yapılan enjeksiyonlarla sağlamlaştırılırken çok daha ağır hasarlı olanları özel yöntemlerle ve  zarar vermeden yerlerinden alınarak arkalarında gerekli temizleme, nem alma ve sağlamlaştırmalar  yapıldıktan sonra çıkarıldıkları yerlere itinayla yapıştırılarak konulmuştur. Desenler üzerlerinde gerekli rötuş ve tamamlamalar yapılarak eski görünümlerine kavuşmaları temin edilmiştir.

Restorasyonu tamamlanan Silahhane Binası, çeşitli kültürel faaliyetlerin gerçekleştirildiği bir mekan olarak kullanılmaktadır.